In der Spezialeinheit Seuchenschutz werden sowohl alle Hygienemaßnahmen und Materialien wie Desinfektionsmittel des Katastrophenschutzbund gesammelt umgesetzt und eingekauft, als auch die Abwehr von biologischen Gefahren koordiniert und ausgeführt.

Die hier tätigen Helfer besitzen mindestens die Qualifikation zum Hygienebeauftragten und können sich zum staatlich geprüften Desinfektor weiterbilden.

Sie dienen sowohl als Ansprechpartner als auch als eigenständige Einheit mit der Aufgabe Gesundheitsgefahren durch Krankheiten, Biologische Stoffe oder vergleichbares einzudämmen und zu beseitigen.

Unterstellt und unterstützt wird die Spezialeinheit durch die Einsatzeinheit Sanität.